Nasce il 9 Agosto 1920 a Lizzano in Belvedere, un paesino dell'Appennino tosco-emiliano in provincia di Bologna.
Il padre č aiuto magazziniere di uno zuccherificio. Appena diciotenne inizia la carriera giornalistica lavorando come cronista al Resto del Carlino, e diventa professionista a 21 anni, etā minima per entrare nell'albo professionale. Protagonista della guerra partigiana entra a Bologna con le truppe di liberazione e annuncia la fine del conflitto dai microfoni del Pwb.
Dal 1952 al 1960 dirige a Milano il settimanale Epoca; di questi anni č l'inizio del suo rapporto con la televisione destinato a rafforzarsi e durare nel tempo: entra alla Rai, e nel 1961 diventa direttore del telegiornale; nel 1962 fonda il primo rotocalco televisivo RT, e nel 1969 cura Dicono di lei, un programma d'interviste a personaggi famosi, alternando al lavoro in televisione l'attivitā di scrittore di libri e la collaborazione con La Stampa (di cui č inviato per una decina d'anni), la Repubblica, Il Corriere della sera e Panorama.
Le principali trasmissioni televisive sono Proibito, inchiesta di attualitāsui fatti della settimana, due grandi cicli di inchieste internazionali, Douce France (1978) Made in England (1980) e un serie di servizi sul traffico d'armi, la mafia ed altri temi di stretta attualitā della societā italiana.
Ideatore e conduttore del primo ciclo di film dossier, nel 1982, e di questo secolo: 1943 e dintorni, nel 1983, ha conquistato il pubblico anche con numerose altre trasmissioni: 1935 e dintorni, Terza B, facciamo l'appello (1971), Linea Diretta (1985, 76 puntate); nel 1986 presenta le quindici puntate del settimanale giornalistico Spot, nell'87 e '88 Il caso (rispettivamente undici e diciotto puntate), nell'89 ancora Linea diretta cinquantacinque puntate, seguita in autunno da Terre lontane (sette film e sette realtā) e Terre vicine, sui mutamenti dei paesi ex comunisti dell'est.
Dal 1991 ad oggi Biagi realizza con la Rai un programma televisivo all'anno: I dieci comandamenti all'italiana (1991), Una Storia, Tocca a noi, La lunga marcia di Mao (sei puntate sulla Cina), Processo al processo su tangentopoli, Le inchieste di Enzo Biagio e il Fatto programmo giornaliero di cinque minuti su avvenimenti e personaggi italiani (1995-1998).
Nel 1998 conduce due nuovi programmi, Fratelli d'Italia e Cara Italia.
Nell'ottobre 1999 parte la sesta edizione del Il Fatto.
Nel luglio 2000 č autore e volto del programma di RaiUno Signore e Signore, mentre nell'ottobre dello stesso anno č di nuovo in video con la settima edizione de Il Fatto.